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The V.A.S.T lab

Variation and Abiotic Stress Tolerance

 

     
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   This page tries to list available and to-come Arabidopsis RILs (or NILs) population, a material useful for quantitative genetics approaches.

   Please help in keeping this up-to-date by emailing me (Olivier Loudet) with new RIL population that you generate(d) or that you heard of... Thanks in advance for the community !

   Crosses highlighted in red are available to the community through either NASC, ABRC or VNAT.

 

Accession Stock Center JIC RIL (1) Natural RIL (2) Salk RIL (3) UTexas RIL (4) Versailles RIL (5) Other RIL Magnus list (6) Core Coll 48 (7)
Abd-0 CS0932                
Ag-0 CS0936 x Cvi           # (CS6601)  
Ak-1 CS0938   x C24            
Akita CS???               #
Alc-0 CS1656               #
An-1 CS0944   x Ler         # (CS6603)  
Bay-0 CS0954         x Shahdara   # (CS6608)  
Bch-1 CS0956   x C24            
Bl-1 CS0968               #
Bla-1 CS0970         x Col-0     #
Blh-1 CS1030         x Col-0     #
Br-0 CS6626 x Kondara         xCol-0(Kars&vanKan 9) #  
Bur-0 CS1028         x Col-0   # (CS6643) #
C24 CS0906   x Col-0 ; Ler ; …         #  
Ca-0 CS1060           x Ler (Vuylsteke 12)    
Can-0 CS1064         x Col-0     #
Can-0 CS6660       x Sav-0        
Co-4 CS1090                
Col-0 CS1092             # (CS6673)  
Ct-1 CS1094 x Wt-5       x Col-0   # (CS6674) #
Cvi CS0902 x Ag-0 CS8580 x Ler     x Col-0   # (CS6675) #
Da(1) CS0917   x Ei-2            
Db-1 CS1102                
Edi-0 CS1122             # (CS6688) #
Ei-2 CS6689   x Da(1)         #  
Eil-0 CS6693           x Lc-0 (Hardtke 11)    
Enkheim-T CS0921               #
Eri-1 CS22548   x Ler            
Es-0 CS6699       x Pa-3        
Est-0 CS1148                
Est-1 CS6701     x Col-0       #  
Fei-0 CS???   x Ler         #  
Ga-0 CS6714 x Nok-3           #  
Ge-0 CS1186       x Col-0     #
Gr-3 CS1202              
Gre-0 CS1210             #
Gu-0 CS6730           #  
Gy-0 CS6732 x Sorbo           #  
Hiroshima CS???                
Ishikawa CS???               #
Ita-0 CS1244         x Col-0     #
JEA CS???         x Col-0     #
Jm-0 CS1259               #
Karelian CS22484               #
Kas-1 CS0903           xTsu-1 (Mc Kay 8) # (CS6751)  
Kas'-2' CS1264   x Ler            
Kas-1 CS3880           x Col-gl1(Somerville)    
Kin-0 CS6755     x Col-0       #  
Kn-0 CS1286               #
Ko-2 CS1288                
Konchezero CS22491             # #
Kondara CS0916 x Br-0             #
Kondara CS6175   x Ler         #  
Kyo-1 (JW1) CS???   x Ler            
Lc-0 CS6769           x Eil-0 (Hardtke 11)    
Ler CS0020 x Col-0           # (CS6928)  
Ler CS8581       x No-0   x Ca-0 (Vuylsteke 12)    
Lip-0 CS1336               #
Ll-0 CS6781   x Ler         #  
Lu-1 CS1352                
Lz-0 CS6788             #  
Mh-0 CS0904                
Mh-0 CS6792                
Mh-1 CS1368               #
Mr-0 CS6795     x Col-0       #  
Mrk-0 CS6796             #  
Ms-0 CS0905             # (CS6797) #
Mt-0 CS1380             # (CS6799) #
Mz-0 CS6800             #  
Nd-1 CS1636         x Col-3/5 (Holub)    
Nd-1 CS6922 x C24         #  
No-0 CS6805     x Ler        
Nok-0 CS6807     x Uk-3        
Nok-1 CS1400       x Col-0     #
Nok-3 CS6810 x Ga-0           #  
Oy-0 CS1436         x Col-0   # (CS6824) #
Pa-1 CS1438               #
Pa-3 CS6827       x Es-0        
Pi-0 CS1454               #
Pinguba CS22485               #
Pro-0 CS???             #  
PYL-1 CS???               #
Ra-0 (Ran) CS1480             # (CS6844) #
Ri-0 CS1492         x Col-0     #
Rld-2 CS1641               #
Rubezhnoe CS0927               #
Sah-0 CS1500               #
Sakata CS???               #
Sampo Mtn CS22492               #
Sap-0 CS1506               #
Sav-0 CS1514               #
Sav-0 CS6856       x Can-0  
x Uk-1 (Hardtke 11)
   
Se-0 CS6852             #  
Sf-2 CS6857       x St-0        
Shahdara CS0929   x Ler     x Bay-0 ; x Col-0   # (CS6180) #
Sorbo CS0931 x Gy-0           #  
Sp-0 CS1530             #
St-0 CS1534     x Sf-2       #
Stw-0 CS1538             #
Ta-0 CS1548             #
Te-0 CS1550             #
Ts-1 CS6868           #  
Ts-5 CS6871 x JIC240#14           #  
Tsu-0 CS1564         x Col-0     #
Tsu-1 CS1640           x Kas-1 (Mc Kay 8) # (CS6926)  
Tul-0 CS1570                
Uk-1 CS6879           x Sav-0 (Hardtke 11)    
Uk-3 CS6880       x Nok-0        
Van-0 CS6884     x Col-0       #  
Wa-1 CS6885           x Col-0 (Wilson 10 !!!) #  
Wei-0 CS6182             #  
Ws CS2223           x W100F (Scolnik)    
Ws-0 CS6891             #  
Ws-2 CS2360             #  
Ws-4 CS5390           x Col-4 (Vuylsteke 12)    
Wt-5 CS6896 x Ct-1           #  
Yo-0 CS1622         x Col-0   # (CS6901) #
 

Number of RIL Pop

7 15 4 5 16 10    

Populations indicated in red are already available through the stock centers or authors.

(1) John Innes Center (Ian Bancroft)

(2) Natural European Project (in this table: from Wageningen, Madrid, Golm, Jena)

(3) The Salk Institute (Joanne Chory - Detlef Weigel)

(4) University of Texas (Alan Lloyd)

(5) INRA Versailles

(6) Magnus Nordborg Sequencing

(7) INRA-CNG ' 48 - Core-Collection ' (a core-collection of Arabidopsis accessions)

(8) John McKay, originally at UC Davis, now at Colorado SU

(9) Jan van Kan and Ilona Kars at Wageningen University

(10) Caution : Wa-1 is a natural autotetraploid ! Col-0 x Wa-1 par Ian Wilson and Shauna Somerville.

(11) Christian Hardtke at University of Lausanne (Mouchel et al., 2004)

(12) Marnik Vuylsteke, VIB Plant Systems Biology, Gent, Belgium

  

 

 

© INRA 2007
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