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Après le séquençage d'un fragment, il faut distinguer les parties codantes (gènes), contenant l'information génétique pour la fabrication des protéines, et les parties non codantes.

Pour repérer les gènes, on recherche :
- les signaux caractéristiques de début et de fin de gène,
- les éléments qui régulent l'expression des gènes, situés en amont du signal de début,
- les parties codantes (exons), qui, à l'intérieur des gènes, portent les instructions pour la synthèse d'une protéine.
Comment fait-on ?
On s'appuie d'abord sur un traitement informatique des données :
- utilisation de programmes informatiques conçus pour détecter des éléments considérés comme caractéristiques de la présence d'un gène,
- comparaison avec des séquences identifiées et accessibles dans des banques de données.

Les résultats acquis par traitement informatique sont ensuite vérifiés par des expériences biologiques.

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Mise à jour : 16 février 2001
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